openforcefield.topology.FrozenMolecule ====================================== .. currentmodule:: openforcefield.topology .. autoclass:: FrozenMolecule .. automethod:: __init__ .. rubric:: Methods .. autosummary:: ~FrozenMolecule.__init__ ~FrozenMolecule.are_isomorphic ~FrozenMolecule.assign_fractional_bond_orders ~FrozenMolecule.assign_partial_charges ~FrozenMolecule.canonical_order_atoms ~FrozenMolecule.chemical_environment_matches ~FrozenMolecule.compute_partial_charges_am1bcc ~FrozenMolecule.enumerate_protomers ~FrozenMolecule.enumerate_stereoisomers ~FrozenMolecule.enumerate_tautomers ~FrozenMolecule.find_rotatable_bonds ~FrozenMolecule.from_bson ~FrozenMolecule.from_dict ~FrozenMolecule.from_file ~FrozenMolecule.from_inchi ~FrozenMolecule.from_iupac ~FrozenMolecule.from_json ~FrozenMolecule.from_mapped_smiles ~FrozenMolecule.from_messagepack ~FrozenMolecule.from_openeye ~FrozenMolecule.from_pdb_and_smiles ~FrozenMolecule.from_pickle ~FrozenMolecule.from_qcschema ~FrozenMolecule.from_rdkit ~FrozenMolecule.from_smiles ~FrozenMolecule.from_toml ~FrozenMolecule.from_topology ~FrozenMolecule.from_xml ~FrozenMolecule.from_yaml ~FrozenMolecule.generate_conformers ~FrozenMolecule.generate_unique_atom_names ~FrozenMolecule.get_bond_between ~FrozenMolecule.is_isomorphic_with ~FrozenMolecule.remap ~FrozenMolecule.strip_atom_stereochemistry ~FrozenMolecule.to_bson ~FrozenMolecule.to_dict ~FrozenMolecule.to_file ~FrozenMolecule.to_hill_formula ~FrozenMolecule.to_inchi ~FrozenMolecule.to_inchikey ~FrozenMolecule.to_iupac ~FrozenMolecule.to_json ~FrozenMolecule.to_messagepack ~FrozenMolecule.to_networkx ~FrozenMolecule.to_openeye ~FrozenMolecule.to_pickle ~FrozenMolecule.to_qcschema ~FrozenMolecule.to_rdkit ~FrozenMolecule.to_smiles ~FrozenMolecule.to_toml ~FrozenMolecule.to_topology ~FrozenMolecule.to_xml ~FrozenMolecule.to_yaml .. rubric:: Attributes .. autosummary:: ~FrozenMolecule.angles ~FrozenMolecule.atoms ~FrozenMolecule.bonds ~FrozenMolecule.conformers ~FrozenMolecule.has_unique_atom_names ~FrozenMolecule.hill_formula ~FrozenMolecule.impropers ~FrozenMolecule.n_angles ~FrozenMolecule.n_atoms ~FrozenMolecule.n_bonds ~FrozenMolecule.n_conformers ~FrozenMolecule.n_impropers ~FrozenMolecule.n_particles ~FrozenMolecule.n_propers ~FrozenMolecule.n_rings ~FrozenMolecule.n_virtual_particles ~FrozenMolecule.n_virtual_sites ~FrozenMolecule.name ~FrozenMolecule.partial_charges ~FrozenMolecule.particles ~FrozenMolecule.propers ~FrozenMolecule.properties ~FrozenMolecule.rings ~FrozenMolecule.torsions ~FrozenMolecule.total_charge ~FrozenMolecule.virtual_sites